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    SNP基因分型服务

    基于过硬的引物合成及标记技术,多重 PCR扩增技术,测序技术,本公司推出SNP分型服务。分型方法包括:直接测序法、连接酶检测反应(LDR)分型方法、多重SNaPshot SNP分型方法、MassArray分型方法以及Taqman探针法等,为广大客户提供多样的选择!


    多种分型平台

    直接测序分型方法

    连接酶检测反应(LDR)分型方法

    多重SnapShot 分型方法

    Taqman探针分型方法


    分型方法

    技术特点

    适宜样本范围

    直接测序方法

    1. Sanger法直接测序

    2.准确性最高,“金标准”

    3. 工作量大、费用高

    适合少量样本,位点数多且集中的分型检测

    连接酶检测反应(LDR)方法

    1. 适用于任何多态性位点,不需要人工引入酶切位点

    2. 分型准确,其准确度可达95%以上

    3. 检出率高,周期短

    4. 性价比高

     100-5000个样品,1-20个位点

    多重SnapShot 方法

    1. 分型准确,其准确度达98%以上

    2. 可多位点同时检测

    3. 不受SNP位点多态特性限制

    4. 不受样品个数的限制

    100-5000个样品,1-40个位点

    Taqman探针法

    1. 基于Taqman探针方法的荧光定量检测

    2. 使用MGB探针,可大大提高信噪比

    3. 准确度高,但探针合成费用较贵

    适合几千个以上样品,10个以下位点数的SNP检测

     

    服务优势

    1. 高质量完成数百万个实验数据

    2. 已服务客户发表SCI文章近百篇

    3. 已成功完成猴子、贝类、鱼类等非常规种属样品的SNP分型

    4. 已完成脑血管、各种癌症、高血压、乙型肝炎等疾病相关位点几千个


    主要服务方案

    1. 直接测序法

    将待检测片段进行PCR扩增并直接测序是SNP检测方法中最准确的方法。纯合位点为单峰,而杂合峰为套峰,因而很容易将几种基因型区分开来。直接测序法不仅可用于对已知位点的检测,还可用于发现未知的SNP位点。

     

    2. 连接酶检测反应(LDR)分型方法

    技术原理:主要应用连接酶检测反应 (ligase detection reaction,LDR)技术。即在Taq DNA连接酶的作用下,当左右两条寡核苷酸探针与目的DNA序列完全互补,并且两条探针之间没有空隙时才能发生连接反应,否则连接反应不能进行,最后通过毛细管电泳,扫描片段长度,实现对SNP 位点的检测。

     

     

    3. 多重SNaPshot SNP分型方法

    技术原理:SNaPshot SNP分型是一种以单碱基延伸原理为基础,同时利用多重PCR对多个已知SNP 位点进行基因分型的方法。在一个含有测序酶,四种荧光标记的ddNTP,紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI 3730XL 测序仪进行毛细管电泳后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定基因型,根据出峰位置确定该延伸产物对应的SNP位点。

     

     

    4.Taqman 探针方法

    在PCR 反应系统中加入2 种不同荧光标记的探针,它们可分别与2个等位基因完全配对。正常情况下,由于探针5′端荧光基团和3′端淬灭基团紧邻在一起,荧光被淬灭。随着PCR 的有效进行,与模板完全配对的探针逐步被Taq DNA 聚合酶5′→3′外切酶活性切割,致使探针5′端上的荧光基团与3′端的淬灭基团分离,淬灭效应解除,报告荧光基团被激活;而与模板不能完全配对的探针(代表另一种等位基因)不能被有效切割,故检测不到荧光信号,通过相应仪器检测荧光值的变化即可实现SNP位点检测。

     

    服务流程

    l 课题的设计咨询包括检测位点的选取

    l 根据实验通量选用不同分型方法

    l DNA样本的质检

    l SNP分型所用引物和探针的设计、合成与优化

    l SNP分型及数据分析


    客户提供信息及样品

    1. SNP位点信息:

    人类基因组需SNP位点的rs号;其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它位点。

    2. 分型样品:

    (1)若分型样品为基因组DNA或质粒DNA ,样品要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>10ul,位点较多的按照1ul/位点计算。纯度 OD 260/OD280 在1.7~1.9之间。由于样品质量差异过大导致的成功率下降,由客户负责。如果要求提供样品纯化服务,我们对每个样品将收取纯化费。

    (2)客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。请在每次寄出样品后及时与本公司分型部联系,可以E-mail 或者传真的方式告知样品的详细信息,以便收到样品后能及时与您进行联系确认。

     

    客户将得到结果

    ★SNPs分型结果(Excel表格)

    ★原始数据(SNP峰型图)

    ★完整实验报告包括扩增和反应的体系,所涉及的引物、探针序列等

     

    文献成果

    捷瑞生物基因分型服务的客户已发表中英文文献达百余篇,点击进入链接www.gubbacciuniforms.com可下载更多SNP基因分型文章。

     

    联系方式

    邮箱:snp@generay.com.cn 

    电话:021-67840429

     

     

     


    友情链接:http://www.hstbio.cn

     

      

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